济南校区学团工作部是在校区党工委和管委的领导下，负责校区学生教育管理、心理健康教育、就业、资助、国防教育及征兵、教室宿舍管理工作；协助做好校区学生工作队伍建设工作；负责校区团的组织建设，做好青年团员思想引领、创新创业、文体活动、志愿服务、社会实践权益维护等工作；负责指导校区学生组织、社团开展工作；完成校区和上级交办的其他工作。

济南校区学团工作部设教育管理科、大学生就业指导中心、大学生心理健康教育中心和教室宿舍管理中心4个科级机构。